Базы данных в биологии и медицине. Генные сети

Cytoscape — инструмент визуализации и анализа генных сетей

Модуль посвящён практическому использованию Cytoscape — одного из ключевых инструментов для визуализации и анализа генных сетей. Слушатели освоят полный цикл работы с Cytoscape: от импорта генных сетей и их визуализации до интеграции транскриптомных данных, наложения метаданных и использования дополнительных модулей для расширенного анализа.

Эксперт программы

Александр Владимирович Бобровских

Младший научный сотрудник ИЦиГ СО РАН
Новосибирский государственный университет
Окончил бакалавриат ФЕН НГУ в 2017 году (генетика) и магистратуру в 2019 году (биоинформатика)
Ph.D. University of Naples Federico II (2023), Sustainable Agricultural and Forestry Systems and Food Security.
С 2017 года работает в ИЦиГ СО РАН

Руководитель и исполнитель ряда грантов РНФ, РФФИ.

Научные интересы: биоинформатика, эволюционная биология, анализ омиксных данных, транскриптомные механизмы регуляции

Соавтор 18 научных статей, h-index = 7

подробнее

оставить заявку

Чему научитесь на курсе

04
Применять биоинформатические подходы к интерпретации омиксных данных

05
Визуализировать молекулярные взаимодействия и выделять ключевые модули регуляции

06
Решать практические задачи на стыке биологии, медицины и ИТ

03
Использовать современные инструменты (Cytoscape, STRING)

01
Работать с биомедицинскими базами и извлекать релевантные данные

02
Понимать принципы построения генных сетей

Обновить свои знания и освоить актуальные методики работы с биологическими данными

оставить заявку

Получить практический опыт в работе с базами данных и реконструкции генных сетей

Развить критическое мышление и системный подход в анализе сложных биологических систем

Курс «Базы данных в биологии и медицине. Генные сети» — это возможность

01

02

Увеличить свою профессиональную ценность и расширить карьерные перспективы в самых востребованных областях науки и медицины

04

03

Стоимость обучения

хочу пройти

20 000 ₽

Налоговый вычет

Как проходит обучение

01

от заявки до получения удостоверения

Мы свяжемся с вами в течение рабочего дня для подтверждения

Оставьте заявку

Осваивайте курс в удобном темпе онлайн

03

04

Получите удостоверение (электронное — сразу, оригинал — за 30 дней)

02

Отправьте пакет документов на d.soloveva@nsu.ru

Я бы хотела написать благодарность за данный курс и преподавателям, и организаторам. Курс сделан очень качественно и понятно. Как раз необходимо было разобраться как работает string и cytoscape. Раньше приходилось искать обучающие ролики на ютубе и они все почти на английском языке или на других языках, что затрудняло усвоение материала. В курсе все понятно, структурированно и я нахожусь под приятным впечатлением, потому что последние пройденные мной курсы от других организаций оставили разочарование от организации до подачи материалов в области биоинформатики. Желаю Вам еще реализовать новые и классные проекты в области биоинформатки и не только.
27 августа

Этот интенсив — идеальный способ, чтобы с нуля войти в тему анализа генных сетей. Программа отлично сбалансирована: от понятной теории и поиска данных до уверенной работы в профессиональном ПО, таком как Cytoscape. Практические задания — главная сила этого курса, они не дают заскучать и помогают сразу закрепить знания. Особенно радует, что курс открывает двери для дальнейшего развития: если проявить усидчивость, можно копнуть очень глубоко и по-настоящему разобраться в теме. Спасибо ПИШ НГУ за такую возможность!

Разработка биоинформатических пайплайнов

Отличный курс от опытных специалистов-практиков, с которого можно и нужно начинать погружение в биоинформатику.

Очень рекомендую данный курс всем, кто занимается генной инженерией и работает с большими базами данных

Геномное редактирование и другие технологии управления свойствами биологических объектов

Спасибо за курс. Он состоял из двух основных частей. В первой был представлен обзор основных биологических баз данных по работе с последовательностями белков, геномов организмов и отдельных генов. Во второй более подробно разбиралось построение и анализ генной сети в программе Cytoscape на основе набора дифференциально-экспрессированных генов по результатам данных NGS. Курс будет полезен тем, кто работает с таким типом объектов и данных.

Машинное обучение и нейронные сети в биологии и медицине

Спасибо за курс! Очень мало ВУЗов предлагают что-то похожее в сфере нейронных сетей/машинного обучения в медицине и биологии.

Машинное обучение и нейронные сети в биологии и медицине

Хочется выразить огромную благодарность организаторам за очень грамотный и логически выстроенный курс! После прохождения лекционного материала большая часть информации укладывается в голове. Также, хочу отметить, что замечательно то, что присутствует большое количество практических заданий, где есть над чем подумать и отработать пройденный материал. Большое спасибо!

Содержание программы полностью соответствовало моим ожиданиям, специалисты, с которыми мы работали, были заинтересованы на 100% в том, чтобы мы смогли в дальнейшем передать полученные знания школьникам, которые будут участвовать в олимпиадах. Уже интересно пройти обучение и по другим программам ПИШ НГУ.

Геномное редактирование и другие технологии управления свойствами биологических объектов

Очень впечатлила высокая квалификация нашего преподавателя — Сергея Евгеньевича Седых, да и всего коллектива ПИШ НГУ и регионального центра «Альтаир», который взаимодействовал с нами в течение обучения. Видно, что эти люди любят свое дело и живут им. Выражаю благодарность коллективу ПИШ НГУ за организацию такого насыщенного обучения.

Все курсы от Передовой инженерной школы по биоинформатике и биомедицине

Linux для биоинформатики

Курс последовательно знакомит с базовыми принципами работы в Linux: от понимания форматов данных до уверенного использования терминала и написания простых bash-скриптов для автоматизации рутинных операций.

8000

Биоинформатические пайплайны с NextFlow

Слушатели осваивают управление программными зависимостями, изоляцию окружения и работу с фреймворком NextFlow для построения и запуска надёжных аналитических процессов.

Курс последовательно охватывает полный классический цикл анализа NGS-данных — от оценки качества сырых прочтений до поиска и аннотации генетических вариантов — с использованием ключевых инструментов, применяемых в современной научной и прикладной практике.

18000

Биологические базы данных. Генные сети и STRING

В рамках курса рассматриваются ключевые биомедицинские информационные ресурсы и основы анализа генных сетей с практическим освоением базы данных STRING.

13000

Cytoscape — инструмент визуализации и анализа генных сетей

В рамках курса слушатели осваивают полный цикл работы с Cytoscape: от импорта генных сетей и их визуализации до интеграции транскриптомных данных, наложения метаданных и использования дополнительных модулей для расширенного анализа.

12500

Основы Python для анализа данных в биологии и медицине

Освоите Python с нуля и пройдёте путь от освоения ключевых конструкций Python до реализации алгоритма глобального выравнивания последовательностей и первичного знакомства с подходами к анализу больших наборов данных, включая single-cell RNA-Seq.

Прикладной анализ данных и машинное обучение в биологии и медицине

Пройдёте путь от интуитивного понимания методов без учителя (кластеризация и понижение размерности) до обучения моделей классификации и регрессии и знакомства с AutoML на примере PyCaret.

Python и нейронные сети в биомедицинских исследованиях: от кода до применения

Освоите практические методы работы с нейронными сетями и научиться применять их к своим данным.

Искусственный интеллект в решении практических задач биологии и медицины

Узнаете, как устроены готовые нейросетевые модели и как применять их для предсказания структур белков, получения новых вариантов последовательностей, оценки свойств химических соединений и решения других прикладных задач.