Расскажем подробнее о программе, ответим на вопросы и поможем понять, подходит ли вам обучение
Запишитесь на вебинар
Генные сети являются одним из ключевых инструментов системной биологии, позволяя описывать функциональные и регуляторные взаимосвязи между генами и молекулярными компонентами клетки. Однако их корректная реконструкция и интерпретация требуют понимания как природы исходных данных, так и методов сетевого анализа.
Для кого: Специалисты биологических, медицинских, химических и IT-направлений
1 Сначала слушатели осваивают методы реконструкции генных сетей по транскриптомным и геномным данным, формируя системное представление о регуляции биологических процессов.
2 Затем они переходят к мультиомиксному уровню анализа, где изучается интеграция различных типов омиксных данных и оценка системных эффектов мутаций в контексте сетевых моделей.
Генные сети: продвинутые подходы по анализу и реконструкции
Данная программа выстроена как последовательная образовательная траектория:
7 октября
18:00 (нск) | 14:00 (мск)
Вебинар Практические инструменты компьютерного зрения для эффективного анализа биологических изображений
Создадим модель для классификации микроскопических изображений
Эксперт программы
Александр Владимирович Бобровских
Младший научный сотрудник ИЦиГ СО РАН Новосибирский государственный университет Окончил бакалавриат ФЕН НГУ в 2017 году (генетика) и магистратуру в 2019 году (биоинформатика) Ph.D. University of Naples Federico II (2023), Sustainable Agricultural and Forestry Systems and Food Security. С 2017 года работает в ИЦиГ СО РАН
Руководитель и исполнитель ряда грантов РНФ, РФФИ.
Научные интересы: биоинформатика, эволюционная биология, анализ омиксных данных, транскриптомные механизмы регуляции
От анализа отдельных типов данных — к их интеграции
От использования готовых инструментов — к самостоятельному анализу
От построения сетей — к их интерпретации
Практическая работа выполняется в среде R с использованием современных пакетов биоинформатики, что позволяет слушателям освоить единый инструментальный стек и применять его в собственных исследованиях.
Курс реализует практико-ориентированный подход, при котором теоретические положения сразу закрепляются на реальных данных
Особое внимание уделяется формированию системного мышления: переходу от анализа отдельных генов и списков дифференциальной экспрессии к построению и интерпретации генных сетей как моделей биологических процессов
Обучение организовано по принципу пошагового усложнения:
Подход к обучению
Программа состоит из следующих блоков
Реконструкция генных сетей по геномным и транскриптомным данным
От данных к сети: методы реконструкции по транскриптомным и геномным данным
После прохождения этого модуля вы сможете уверенно реконструировать и интерпретировать генные сети по транскриптомным и ChIP-seq данным, переходя от списков генов к системному пониманию регуляции биологических процессов.
р.
р.
Мультиомиксная реконструкция генных сетей и системный анализ эффектов мутаций
От сети к функции: мультиомиксная интеграция и системная интерпретация
После прохождения этого модуля вы сможете уверенно интегрировать мультиомиксные данные, реконструировать генные сети и анализировать системные эффекты мутаций в биологических процессах.
р.
р.
Понимает генные сети как универсальную модель анализа биологических систем
Готов к участию в междисциплинарных проектах и работе на стыке биологии, биоинформатики и медицины
Я бы хотела написать благодарность за данный курс и преподавателям, и организаторам. Курс сделан очень качественно и понятно. Как раз необходимо было разобраться как работает string и cytoscape. Раньше приходилось искать обучающие ролики на ютубе и они все почти на английском языке или на других языках, что затрудняло усвоение материала. В курсе все понятно, структурированно и я нахожусь под приятным впечатлением, потому что последние пройденные мной курсы от других организаций оставили разочарование от организации до подачи материалов в области биоинформатики. Желаю Вам еще реализовать новые и классные проекты в области биоинформатки и не только. 27 августа
Этот интенсив — идеальный способ, чтобы с нуля войти в тему анализа генных сетей. Программа отлично сбалансирована: от понятной теории и поиска данных до уверенной работы в профессиональном ПО, таком как Cytoscape. Практические задания — главная сила этого курса, они не дают заскучать и помогают сразу закрепить знания. Особенно радует, что курс открывает двери для дальнейшего развития: если проявить усидчивость, можно копнуть очень глубоко и по-настоящему разобраться в теме. Спасибо ПИШ НГУ за такую возможность!
Разработка биоинформатических пайплайнов
Отличный курс от опытных специалистов-практиков, с которого можно и нужно начинать погружение в биоинформатику.
Спасибо за курс. Он состоял из двух основных частей. В первой был представлен обзор основных биологических баз данных по работе с последовательностями белков, геномов организмов и отдельных генов. Во второй более подробно разбиралось построение и анализ генной сети в программе Cytoscape на основе набора дифференциально-экспрессированных генов по результатам данных NGS. Курс будет полезен тем, кто работает с таким типом объектов и данных.
Машинное обучение и нейронные сети в биологии и медицине
Спасибо за курс! Очень мало ВУЗов предлагают что-то похожее в сфере нейронных сетей/машинного обучения в медицине и биологии.
Машинное обучение и нейронные сети в биологии и медицине
Хочется выразить огромную благодарность организаторам за очень грамотный и логически выстроенный курс! После прохождения лекционного материала большая часть информации укладывается в голове. Также, хочу отметить, что замечательно то, что присутствует большое количество практических заданий, где есть над чем подумать и отработать пройденный материал. Большое спасибо!
Содержание программы полностью соответствовало моим ожиданиям, специалисты, с которыми мы работали, были заинтересованы на 100% в том, чтобы мы смогли в дальнейшем передать полученные знания школьникам, которые будут участвовать в олимпиадах. Уже интересно пройти обучение и по другим программам ПИШ НГУ.
Очень впечатлила высокая квалификация нашего преподавателя — Сергея Евгеньевича Седых, да и всего коллектива ПИШ НГУ и регионального центра «Альтаир», который взаимодействовал с нами в течение обучения. Видно, что эти люди любят свое дело и живут им. Выражаю благодарность коллективу ПИШ НГУ за организацию такого насыщенного обучения.
Продолжая использовать сайт, вы даёте согласие на использование cookies и понимаете, что информация на сайте не является публичной офертой и носит исключительно информационный характер. Узнайте подробности или измените свои настройки cookies