Аналитик биомедицинских данных и генных сетей

20000,00
р.
25500,00
р.
Курс: «Базы данных в биологии и медицине. Генные сети»

Научитесь работать с генетическими и биомедицинскими данными, использовать базы и строить генные сети для реальных исследовательских задач.

Программа подготовлена при консультативной поддержке экспертов ИЦ Хелснет НТИ
О программе
Подход к обучению
Образовательные модули программы
Характеристики курса

О программе

Современная наука переживает качественный скачок благодаря интеграции информационных технологий в биологию и медицину. Для исследования сложных биологических процессов требуется не только глубокое понимание молекулярных механизмов, но и умение работать с огромными массивами данных.

Наш курс создан для того, чтобы дать слушателям все необходимые инструменты для анализа биологических баз данных и реконструкции генных сетей. Это позволяет находить новые закономерности в работе клеток, прогнозировать развитие патологий и разрабатывать инновационные методы диагностики и лечения.

  • Вы научитесь ориентироваться в крупнейших базах биологических данных: NCBI, KEGG, ClinVar, Uniprot, RCSB PDB
  • Освоите работу с: AlphaFold, AmiGO, ESM Metagenomic Atlas,
  • Поймёте, как находить нужную информацию: от генетических мутаций до 3D-структур белков.

Разберётесь, как устроены генные сети — и как использовать их для анализа взаимодействий, функций, экспрессий и биологических процессов:
  • Сконструируете свою сеть через STRING
  • Научитесь визуализировать и анализировать её в Cytoscape, используя реальные данные

Образовательная траектория предназначена для:

  • Студентов и выпускников биологических, медицинских, химических и IT-направлений
  • Специалистов в области биоинформатики, биотехнологий, фармацевтики
  • Исследователей, анализирующих омиксные данные (геномика, транскриптомика и др.)
  • Сотрудников R&D-отделов, заинтересованных в системной биологии и анализе молекулярных взаимодействий

Подход к обучению

Все занятия ориентированы на практику: вы не просто узнаете, но примените знания в заданиях, приближенных к настоящим исследовательским ситуациям. В эпоху цифровизации и больших данных биология и медицина требуют специалистов, умеющих работать с современными инструментами анализа.

Записывайтесь на курс и станьте экспертом в области анализа генетических данных, открывая новые горизонты в научных исследованиях и медицинских инновациях!

Цели и результаты обучения:

  • Обновить свои знания и освоить актуальные методики работы с биологическими данными
  • Получить практический опыт в работе с базами данных и реконструкции генных сетей
  • Развить критическое мышление и системный подход в анализе сложных биологических систем
  • Увеличить свою профессиональную ценность и расширить карьерные перспективы в самых востребованных областях науки и медицины

Чему научитесь на курсе:

  • Работать с биомедицинскими базами и извлекать релевантные данные
  • Понимать принципы построения генных сетей
  • Использовать современные инструменты (Cytoscape, STRING)
  • Применять биоинформатические подходы к интерпретации омиксных данных
  • Визуализировать молекулярные взаимодействия и выделять ключевые модули регуляции
  • Решать практические задачи на стыке биологии, медицины и ИТ

Образовательные модули программы

Биологические базы данных. Генные сети и STRING

Тема 1. Введение в базы данных в биологии и медицине
Тема 2. Генные сети, их свойства и область применения
Тема 3. Основные подходы для реконструкции генных сетей. Примеры использования
Тема 4. Знакомство с базой данных String

Модуль посвящён биологическим базам данных и концепции генных сетей как инструменту системной биологии. Рассматриваются ключевые биомедицинские информационные ресурсы и основы анализа генных сетей с практическим освоением базы данных STRING.
Подробнее о модуле

Cytoscape — инструмент визуализации и анализа генных сетей

Тема 1. Реконструкция генных сетей по транскриптомным данным
Тема 2. Экспорт генной сети в Cytoscape. Визуализация и раскладка генной сети.
Тема 3. Добавление метаданных в Cytoscape. Визуализация метаданных
Тема 4. Дополнительный функционал Cytoscape. Установка и использование

Слушатели осваивают полный цикл работы с Cytoscape: от импорта генных сетей и их визуализации до интеграции транскриптомных данных, наложения метаданных и использования дополнительных модулей для расширенного анализа.
Подробнее о модуле

Характеристики курса

Характеристики курса:

  • Продолжительность: 36 ак. ч.
  • Направления: сетевая биология, базы данных
  • Навыки: поиск и интерпретация биологических данных, анализ генных сетей, системная интерпретация результатов, интеграция транскриптомных данных
  • Инструменты: NCBI, UniProt, ClinVar, RCSB PDB, AlphaFold3 Server, Cytoscape и его плагины, GEO, STRING
  • Документ об образовании: удостоверении о повышении квалификации НГУ

Эксперты образовательной траектории:

  • Бобровских Александр Владимирович, старший преподаватель ФЕН НГУ, м.н.с. ИЦИГ СО РАН
  • Егор Олегович Укладов, преподаватель НГУ, преподаватель кафедры биологии СУНЦ НГУ, сотрудник центра коллективного пользования «Сибирский кольцевой источник фотонов»