Подпишитесь на рассылку
Заполните форму, и мы отправим вам ссылку на участие
22 июля
18:00 (нск) | 14:00 (мск)
Бесплатный вебинар
SNP и GWAS: cетевая интерпретация без кода
SNP и GWAS: cетевая интерпретация без кода
Разберём, как перейти от списка SNP и результатов GWAS к биологической интерпретации: от поиска связанных генов и построения генных сетей — до выявления хабовых генов, функциональных модулей и ключевых биологических процессов
На вебинаре вы:
- Разберёте, как интерпретировать GWAS-данные и переходить от списка SNP к биологическому механизму
- Узнаете, как загрузить результаты GWAS-анализа в FUMA и получить список генов для дальнейшего анализа.
- Научитесь строить простые генные сети в браузере с помощью NetworkAnalyst.
- Поймете, как анализировать хабовые гены и функциональные модули.
- Освоите практический пайплайн: как превратить таблицы GWAS-ассоциаций в интерпретируемые генные сети и графики.
за списком SNP нужно увидеть биологический механизм и понять, как результаты анализа связаны с изучаемым признаком.
На практике после получения GWAS-результатов часто сложно перейти к системной интерпретации: определить связанные гены, построить их сетевое окружение, выделить хабовые гены и функциональные модули.
На вебинаре разберём практический путь от GWAS-ассоциаций к осмысленной биологической системе: загрузим данные в FUMA, получим список генов, построим генную сеть в NetworkAnalyst и сопоставим модули с биологическими процессами и фенотипом.
На практике после получения GWAS-результатов часто сложно перейти к системной интерпретации: определить связанные гены, построить их сетевое окружение, выделить хабовые гены и функциональные модули.
На вебинаре разберём практический путь от GWAS-ассоциаций к осмысленной биологической системе: загрузим данные в FUMA, получим список генов, построим генную сеть в NetworkAnalyst и сопоставим модули с биологическими процессами и фенотипом.
Задача интерпретации GWAS-данных нетривиальна:
01
магистрантам, аспирантам и молодым учёным биологических направлений, которым нужны современные инструменты для анализа и интерпретации GWAS-данных
магистрантам, аспирантам и молодым учёным биологических направлений, которым нужны современные инструменты для анализа и интерпретации GWAS-данных
05
специалистам, которым важно научиться связывать SNP с генами, сетями взаимодействий и биологическими процессами
специалистам, которым важно научиться связывать SNP с генами, сетями взаимодействий и биологическими процессами
02
селекционерам, которые хотят понять, как переходить от результатов GWAS к биологической интерпретации признаков
селекционерам, которые хотят понять, как переходить от результатов GWAS к биологической интерпретации признаков
03
начинающим биоинформатикам, осваивающим методы анализа генетических данных
начинающим биоинформатикам, осваивающим методы анализа генетических данных
Для кого этот вебинар
06
всем, кто интересуется современными базами данных, сетевым анализом и системным подходом к изучению биологических данных
всем, кто интересуется современными базами данных, сетевым анализом и системным подходом к изучению биологических данных
04
исследователям, которые уже работали с GWAS, но хотят разобраться в возможностях интерпретации и выборе подходящих инструментов
исследователям, которые уже работали с GWAS, но хотят разобраться в возможностях интерпретации и выборе подходящих инструментов
Вебинар рассчитан на студентов, молодых исследователей и специалистов, которые работают с генетическими данными и интересуются интерпретацией результатов GWAS. Он будет особенно полезен:
Спикер
Александр Владимирович Бобровских
Младший научный сотрудник ИЦиГ СО РАН
Новосибирский государственный университет
Окончил бакалавриат ФЕН НГУ в 2017 году (генетика) и магистратуру в 2019 году (биоинформатика)
Ph.D. University of Naples Federico II (2023), Sustainable Agricultural and Forestry Systems and Food Security.
С 2017 года работает в ИЦиГ СО РАН
Новосибирский государственный университет
Окончил бакалавриат ФЕН НГУ в 2017 году (генетика) и магистратуру в 2019 году (биоинформатика)
Ph.D. University of Naples Federico II (2023), Sustainable Agricultural and Forestry Systems and Food Security.
С 2017 года работает в ИЦиГ СО РАН
Руководитель и исполнитель ряда грантов РНФ, РФФИ.
Научные интересы: биоинформатика, эволюционная биология, анализ омиксных данных, транскриптомные механизмы регуляции
Соавтор 18 научных статей, h-index = 7
подробнее
Научные интересы: биоинформатика, эволюционная биология, анализ омиксных данных, транскриптомные механизмы регуляции
Соавтор 18 научных статей, h-index = 7
подробнее
SNP и GWAS: основные понятия
Кратко разберём концепцию SNP и GWAS и обсудим, почему после получения списка ассоциаций нужен отдельный этап интерпретации
Кратко разберём концепцию SNP и GWAS и обсудим, почему после получения списка ассоциаций нужен отдельный этап интерпретации
От GWAS к генам
Покажем, как загрузить GWAS данные в FUMA и получить список генов для дальнейшего анализа
Покажем, как загрузить GWAS данные в FUMA и получить список генов для дальнейшего анализа
Генная сеть в NetworkAnalyst
Разберём, как найти сетевое окружение и построить генную сеть в NetworkAnalyst, который использует STRING-db для построения белок-белковых взаимодействий
Разберём, как найти сетевое окружение и построить генную сеть в NetworkAnalyst, который использует STRING-db для построения белок-белковых взаимодействий
Что будет на вебинаре
01
02
Хабовые гены, модули и биологический контекст
Покажем, как анализировать хабовые гены и функциональные модули, а затем сопоставлять их с биологическими процессами и фенотипом
Покажем, как анализировать хабовые гены и функциональные модули, а затем сопоставлять их с биологическими процессами и фенотипом
04
03
Что вы получите после вебинара
04
Поймете, как получать список генов через FUMA и строить сетевое окружение в NetworkAnalyst
05
Узнаете, как анализировать хабовые гены и функциональные модули
06
Познакомитесь с базой белок-белковых взаимодействий STRING-db
Поймете, как получать список генов через FUMA и строить сетевое окружение в NetworkAnalyst
05
Узнаете, как анализировать хабовые гены и функциональные модули
06
Познакомитесь с базой белок-белковых взаимодействий STRING-db
01
Научитесь интерпретировать GWAS-данные и переходить от списка SNP к биологическому механизму
02
Разберёте алгоритм интерпретации GWAS-результатов: от таблиц с ассоциациями до генных сетей и графиков
03
Научитесь строить простые генные сети, не выходя из браузера
Научитесь интерпретировать GWAS-данные и переходить от списка SNP к биологическому механизму
02
Разберёте алгоритм интерпретации GWAS-результатов: от таблиц с ассоциациями до генных сетей и графиков
03
Научитесь строить простые генные сети, не выходя из браузера
Продолжая использовать сайт, вы даёте согласие на использование cookies и понимаете, что информация на сайте не является публичной офертой и носит исключительно информационный характер. Узнайте подробности или измените свои настройки cookies