Вернуться к образовательным траекториям

Архитектор генных сетей

20000,00
р.
25000,00
р.
Подать заявку
Курс: «Генные сети: продвинутые подходы по анализу и реконструкции»

Курс представляет собой образовательную траекторию, состоящую из двух модулей, посвящённых современным методам системного анализа биологических данных.

Программа ориентирована на слушателей, которые работают с омиксными данными и хотят перейти от анализа отдельных наборов данных и списков генов к реконструкции, анализу и интерпретации генных сетей как моделей регуляции и организации биологических процессов.

Программа подготовлена при консультативной поддержке экспертов ИЦ Хелснет НТИ
О программе
Подход к обучению
Образовательные модули программы
Характеристики курса

О программе

Генные сети являются одним из ключевых инструментов системной биологии, позволяя описывать функциональные и регуляторные взаимосвязи между генами и молекулярными компонентами клетки. Однако их корректная реконструкция и интерпретация требуют понимания как природы исходных данных, так и методов сетевого анализа.

Данная программа выстроена как последовательная образовательная траектория. Сначала слушатели осваивают методы реконструкции генных сетей по транскриптомным и геномным данным, формируя системное представление о регуляции биологических процессов. Затем они переходят к мультиомиксному уровню анализа, где изучается интеграция различных типов омиксных данных и оценка системных эффектов мутаций в контексте сетевых моделей.

Подход к обучению

Во всех модулях акцент сделан на практическую работу в среде R, использование реальных исследовательских данных и формирование навыков самостоятельного анализа, применимых в научных и прикладных задачах.

Для кого этот курс:
  • Студенты-магистры биологических и биомедицинских направлений.
  • Начинающие биоинформатики и биологи с базовыми навыками программирования (R или Python).
  • Аспиранты и молодые учёные в области молекулярной биологии, генетики и биомедицины.
  • Специалисты смежных областей (врачи, фармакологи, селекционеры), заинтересованные в методах системной биологии.
  • Программа рассчитана на слушателей, которые имеют опыт работы с омиксными данными и готовы к освоению продвинутых сетевых подходов.

По итогам прохождения программы слушатель:
  • Понимает генные сети как универсальную модель анализа биологических систем.
  • Умеет реконструировать генные сети по транскриптомным, геномным и мультиомиксным данным.
  • Способен анализировать и интерпретировать сетевые взаимодействия и системные эффекты мутаций.
  • Обладает практическими навыками применения сетевого анализа в собственных исследованиях.
  • Готов к участию в междисциплинарных проектах и работе на стыке биологии, биоинформатики и медицины.

Образовательные модули программы

Модуль 1. Реконструкция генных сетей по геномным и транскриптомным данным

Тема 1. Транскриптомные данные как источник информации о сетевых взаимодействиях
Тема 2. Геномные и ChIP-seq данные как источники регуляторных взаимодействий

Модуль посвящён системному анализу транскриптомных и ChIP-seq данных как источников информации о функциональных и регуляторных взаимодействиях.
Слушатели изучают принципы построения генных сетей по данным экспрессии, способы включения регуляторной информации и базовые подходы к анализу и интерпретации сетевых моделей.
Практическая часть реализуется в среде R и направлена на освоение сетевого анализа и функциональной интерпретации генных сетей.
Подробнее о модуле

Модуль 2. Мультиомиксная реконструкция генных сетей и системный анализ эффектов мутаций

Тема 1. Мультиомиксный подход к реконструкции генных сетей
Тема 2. От сети к функции: системная интерпретация генетических вариаций

Модуль посвящён интеграции различных типов омиксных данных и анализу системных эффектов генетических вариаций.
Рассматриваются мультиомиксные подходы к реконструкции генных сетей, методы анализа структуры сети и интерпретации сетевых взаимодействий, а также оценка влияния мутаций на биологические процессы.
Практическая часть основана на работе с реальными исследовательскими кейсами и публично доступными данными.
Подробнее о модуле

Характеристики курса

Характеристики курса:

  • Продолжительность: 38 ак. ч.
  • Направления: сетевая биология, анализ омиксных данных, программирование на R.
  • Навыки: реконструкция генных сетей, сетевой анализ, интеграция омиксных данных, системная интерпретация эффектов мутаций.
  • Инструменты: R, RStudio, WGCNA, igraph, clusterProfiler, ChIPseeker, STRINGdb, mixOmics, ggplot2.
  • Документ об образовании: удостоверении о повышении квалификации НГУ

Эксперт образовательной траектории:

  • Бобровских Александр Владимирович, старший преподаватель ФЕН НГУ, м.н.с. ИЦИГ СО РАН