Оставьте контактные данные и мы отправим вам демо-версию курса
«Генные сети: продвинутые подходы по анализу и реконструкции»
Генные сети являются одним из ключевых инструментов системной биологии, позволяя описывать функциональные и регуляторные взаимосвязи между генами и молекулярными компонентами клетки. Однако их корректная реконструкция и интерпретация требуют понимания как природы исходных данных, так и методов сетевого анализа.
Для кого: Специалисты биологических, медицинских, химических и IT-направлений
1 Сначала слушатели осваивают методы реконструкции генных сетей по транскриптомным и геномным данным, формируя системное представление о регуляции биологических процессов.
2 Затем они переходят к мультиомиксному уровню анализа, где изучается интеграция различных типов омиксных данных и оценка системных эффектов мутаций в контексте сетевых моделей.
Генные сети: продвинутые подходы по анализу и реконструкции
Данная программа выстроена как последовательная образовательная траектория:
13 мая
14:00 (нск) | 10:00 (мск)
Вебинар От списка генов до гипотезы: чем могут быть полезны базы данных и генные сети?
На вебинаре покажем рабочий пайплайн быстрой интерпретации таких данных.
Вы увидите, как за 45 минут с помощью публичных баз и браузерных инструментов можно:
Собрать «досье» на ген: функции, известные мутации, связь с заболеваниями
Увидеть биологический контекст: партнёры гена, в каких путях и генных сетях он участвует
Получить гипотезу для статьи с использованием транскриптомных данных
Создать наглядную визуализацию для презентации или научной статьи
На вебинаре обойдемся без программирования и разберем универсальный алгоритм такой интерпретации на примере онкогена и RNA-seq данных
Вебинар для вас, если:
Вы работаете с омиксными данными и устали интерпретировать гены вручную
Вам нужно обосновать выбор кандидатных генов или сформулировать научную гипотезу
Вам нужен системный и воспроизводимый подход в анализе данных
Знакомая ситуация: вы получили список генов из дифференциального анализа, или коллега прислал интересный ген для проверки. И вы не знаете, что делать с этим дальше. Гуглить каждый ген вручную или искать отдельные статьи? Это не даст целостной картины, и отнимет много времени.
Спикер: Александр Владимирович Бобровских
Запишитесь на бесплатный вебинар, чтобы научиться быстрее интерпретировать гены-кандидаты для исследований, проектов и анализа омиксных данных
Эксперт программы
Александр Владимирович Бобровских
Младший научный сотрудник ИЦиГ СО РАН Новосибирский государственный университет Окончил бакалавриат ФЕН НГУ в 2017 году (генетика) и магистратуру в 2019 году (биоинформатика) Ph.D. University of Naples Federico II (2023), Sustainable Agricultural and Forestry Systems and Food Security. С 2017 года работает в ИЦиГ СО РАН
Руководитель и исполнитель ряда грантов РНФ, РФФИ.
Научные интересы: биоинформатика, эволюционная биология, анализ омиксных данных, транскриптомные механизмы регуляции
От анализа отдельных типов данных — к их интеграции
От использования готовых инструментов — к самостоятельному анализу
От построения сетей — к их интерпретации
Практическая работа выполняется в среде R с использованием современных пакетов биоинформатики, что позволяет слушателям освоить единый инструментальный стек и применять его в собственных исследованиях.
Курс реализует практико-ориентированный подход, при котором теоретические положения сразу закрепляются на реальных данных
Особое внимание уделяется формированию системного мышления: переходу от анализа отдельных генов и списков дифференциальной экспрессии к построению и интерпретации генных сетей как моделей биологических процессов
Обучение организовано по принципу пошагового усложнения:
Я бы хотела написать благодарность за данный курс и преподавателям, и организаторам. Курс сделан очень качественно и понятно. Как раз необходимо было разобраться как работает string и cytoscape. Раньше приходилось искать обучающие ролики на ютубе и они все почти на английском языке или на других языках, что затрудняло усвоение материала. В курсе все понятно, структурированно и я нахожусь под приятным впечатлением, потому что последние пройденные мной курсы от других организаций оставили разочарование от организации до подачи материалов в области биоинформатики. Желаю Вам еще реализовать новые и классные проекты в области биоинформатки и не только. 27 августа
Этот интенсив — идеальный способ, чтобы с нуля войти в тему анализа генных сетей. Программа отлично сбалансирована: от понятной теории и поиска данных до уверенной работы в профессиональном ПО, таком как Cytoscape. Практические задания — главная сила этого курса, они не дают заскучать и помогают сразу закрепить знания. Особенно радует, что курс открывает двери для дальнейшего развития: если проявить усидчивость, можно копнуть очень глубоко и по-настоящему разобраться в теме. Спасибо ПИШ НГУ за такую возможность!
Разработка биоинформатических пайплайнов
Отличный курс от опытных специалистов-практиков, с которого можно и нужно начинать погружение в биоинформатику.
Спасибо за курс. Он состоял из двух основных частей. В первой был представлен обзор основных биологических баз данных по работе с последовательностями белков, геномов организмов и отдельных генов. Во второй более подробно разбиралось построение и анализ генной сети в программе Cytoscape на основе набора дифференциально-экспрессированных генов по результатам данных NGS. Курс будет полезен тем, кто работает с таким типом объектов и данных.
Машинное обучение и нейронные сети в биологии и медицине
Спасибо за курс! Очень мало ВУЗов предлагают что-то похожее в сфере нейронных сетей/машинного обучения в медицине и биологии.
Машинное обучение и нейронные сети в биологии и медицине
Хочется выразить огромную благодарность организаторам за очень грамотный и логически выстроенный курс! После прохождения лекционного материала большая часть информации укладывается в голове. Также, хочу отметить, что замечательно то, что присутствует большое количество практических заданий, где есть над чем подумать и отработать пройденный материал. Большое спасибо!
Содержание программы полностью соответствовало моим ожиданиям, специалисты, с которыми мы работали, были заинтересованы на 100% в том, чтобы мы смогли в дальнейшем передать полученные знания школьникам, которые будут участвовать в олимпиадах. Уже интересно пройти обучение и по другим программам ПИШ НГУ.
Очень впечатлила высокая квалификация нашего преподавателя — Сергея Евгеньевича Седых, да и всего коллектива ПИШ НГУ и регионального центра «Альтаир», который взаимодействовал с нами в течение обучения. Видно, что эти люди любят свое дело и живут им. Выражаю благодарность коллективу ПИШ НГУ за организацию такого насыщенного обучения.
Все курсы от Передовой инженерной школы по биоинформатике и биомедицине
Продолжая использовать сайт, вы даёте согласие на использование cookies и условиями пользовательского соглашения. Узнайте подробности или измените свои настройки cookies.